Las causas orgánicas específicas deben ser tratadas de entrada ,pero el estreñimiento funcional es tratado inicialmente con cambios en la dieta y modificación de la conducta
Los cambios en la dieta incluyen agregar zumos de ciruela, aumentando las frutas y verduras para los niños mayores, aumentar el consumo de agua y disminuyendo la cantidad de alimentos astringentes como la leche y el queso.
La modificación del comportamiento en niños mayores implica ir al baño de forma regular después de las comidas y proporcionar una tabla de refuerzo abdominal . Para los niños que están en proceso de entrenamiento,a veces vale la pena darles un descanso del entrenamiento hasta que haya pasado la preocupación de estreñimiento.
El estreñimiento insensible es tratado promoviendo la motilidad del intestino y mantener una rutina regular de la dieta, a veces con la ayuda de agentes orales o con grandes volúmenes de liquidos.