La estomatitis es la hinchazón y el enrojecimiento de la mucosa bucal o la aparición de úlcera dolorosas(únicas o múltiples). Con menor frecuencia se observan lesiones blanquecinas y, en raras ocasiones, la boca aparece normal (síndrome de boca ardiente) a pesar de los síntomas significativos.
Los síntomas dificultan la alimentación; a veces lleva a deshidratación o desnutrición.