La faringitis por sí misma es fácil de reconocer clínicamente; sin embargo, su causa no lo es.

La rinorrea y la tos suelen indicar una causa vírica.

La mononucleosis infecciosa cursa con malestar general, cansancio, hepatoesplenomegalia y adenopatía cervical posterior, con petequias del velo del paladar y exudados amigdalares.

Una membrana gruesa, gris, sucia y dura que sangra puede indicar difteria, aunque esto es cada vez más esporádico debido a la vacunación.

Las pruebas antigénicas son específicas pero no sensibles y deberán ir seguidas de un cultivo, que tiene una especificidad de aproximadamente el 90% y una sensibilidad del 90%.